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Épidémiologie dans le CBNPC avec altérations

La prise en charge du CBNPC nécessite une recherche d’altérations moléculaires systématique. Cette identification permettra de proposer un traitement par thérapie ciblée1.

Proposition de panel minimal de biologie moléculaire pour les CBNPC de stade avancé1
  Avant L1 Avant L2
PDL1 IHC  
EGFR    
KRAS    
BRAF    
HER2    
MET ex14    
Autres MET    
ALK IHC  
ROS1    
RET Si disponible Si disponible
NTRK    
NGR1   Si disponible
RB1 IHC / TNE  
STK11 TNE  
TP53 TNE  
 

Légende :
Avoir le résultat systématiquement
⯀  En option
  Technique habituelle/disponible si vide
 

IHC : Immuno-Histochimie ; TNE : En cas de tumeur Neuro-endocrine (hors CBPC).

Différentes méthodes d’analyse des mutations5​​​​​​​
Méthodes Matériel Avantages Limites
FISH ADN Largement disponible et utilisée de manière routinière par de nombreux laboratoires
Plus rapide que les techniques NGS
Difficultés d'interprétation
Manque d'évolutivité pour les tests multi-cibles à grand volume
PCR ancrée multiplexe  ARN Sensibilité et spécificité cliniques supérieures à celles des tests FISH standard.
Permet d'enrichir une région cible avec la connaissance d'une seule de ses extrémités (contrairement aux autres méthodes de PCR) et peut être utilisée pour évaluer la complexité de la lecture de la séquence en fonction des sites de départ aléatoires
La qualité des échantillons archivés peut être compromise
Coûteuse
NGS ADN Nécessite généralement une faible quantité de matériel tumoral (faible quantité d'ADN) Résultats moins fiables que ceux du séquençage ciblé de l'ARN
Séquençage ARN ciblé ARN Peut être plus fiable que le NGS de l’ADN
Non affecté par les grandes régions introniques
Nécessite un faible apport d'ARN
Stockage à long terme des échantillons non recommandé
IHC Protéines Technique répandue
Plus rapide que les autres techniques
Dépend de la disponibilité d'anticorps de bonne qualité et de la notation qualitative

Définitions :

  • Mutation : Tout changement dans la séquence d'ADN d'une cellule6.
  • Translocation : Fixation d'un segment de chromosome sur un autre chromosome6
  • Gène de fusion : Un gène de fusion est un gène hybride formé de deux gènes précédemment indépendants6.
  • Réarrangement : Assemblage réunissant plusieurs morceaux d'ADN initialement non contigus, certains réarrangements conduisant à la formation de gènes fonctionnels7.

FISH : fluorescence in situ hybridization ; NGS : Next generation sequencing ; IHC : immunohistochemistry.

PP-ONC-FRA-1533

Références
  1. AURA. Référentiels Auvergne Rhône-Alpes en oncologie thoracique. Cancer bronchique non à petites cellules. 17e édition. 2021.
  2. Barlesi F, et al. Routine molecular profiling of patients with advanced non-small-cell lung cancer: results of a 1-year nationwide programme of the French Cooperative Thoracic Intergroup (IFCT). Lancet, 2016;387:1415-26.
  3. Stencel K, et al. Non-Small-Cell Lung Cancer: New Rare Targets – New Targeted Therapies – State of The Art and Future Directions. Cancers; 2021,13,1829. https://doi.org/10.3390/cancers13081829.
  4. Griesinger F, et al. Biomarker testing in non-small cell lung cancer in routine care: Analysis of the first 3,717 patients in the German prospective, observational, nation-wide CRISP Registry (AIO-TRK-0315). Lung Cancer, 2021;152:174–184.
  5. Laskin J, et al. NRG1 fusion-driven tumors: biology, detection, and the therapeutic role of afatinib and other ErbB-targeting agents. Ann Oncol, 2020; 31(12): 1693-1703.
  6. National Cancer Institute. Dictionnaire des termes du cancer. https://www.cancer.gov/publications/dictionaries/cancer-terms. Consulté le 12 mai 2021.
  7. Stratton M, et al. The cancer genome. Nature, 2009;458:719-724.
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